Опубликованно информационное письмо ФНС России от 27 июня 2019 г. N ЕД-4-20/12490@ из которого можно узнать, что налоговым инспекциям разрешено проверять плательщиков НПД только после специального разрешения управления оперативного контроля ФНС:

Федеральная налоговая служба в дополнение к письму ФНС России от 24.04.2019 N ЕД-4-20/7915@ сообщает, что необходимо приостановить проведение контрольных мероприятий в отношении налогоплательщиков налога на профессиональный доход (далее — налогоплательщик НПД) в части соблюдения указанными налогоплательщиками условий применения специального налогового режима «Налог на профессиональный доход» до согласования с Управлением оперативного контроля ФНС России.

Кроме того, проведение контрольных мероприятий, предполагающих взаимодействие (вызовы, запросы разъяснений и т.д.) с налогоплательщиками НПД, в части соблюдения налогоплательщиками НПД условий применения специального налогового режима «Налог на профессиональный доход» не должно осуществляться без предварительного согласования с Управлением оперативного контроля ФНС России.

Это значит, что проверки самозанятых возможны, но только в исключительных случаях, когда речь идет о злостных нарушениях. И только после специального разрешения управления оперативного контроля ФНС.

"Ip-samozanyat.com" - ( https://ip-samozanyat.com/news/zapretili-proveryat-samozanyatykh-bez-razresheniya.html )