Российская Национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2, известная как VGARus, продолжает активно пополняться. На текущий момент в базе данных уже содержится более 40 тысяч последовательностей SARS-CoV-2.

Эта база данных была зарегистрирована в начале июня в соответствии с постановлением №448 Правительства России. Основным разработчиком и консолидирующим центром стал Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.

На сегодняшний день в Национальную базу данных загружено более 40 тысяч геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2. Среди них более 19 тысяч полногеномных последовательностей и свыше 21 тысячи фрагментов генома S-белка, который позволяет определять ключевые мутации.

Это значительное пополнение российской базы данных стало возможным благодаря активному участию научных учреждений Роспотребнадзора, включая ЦНИИ Эпидемиологии, ГНЦ ВБ Вектор, ГНЦ Прикладной микробиологии и биотехнологии, НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Российский НИПЧИ «Микроб» и других.

Постоянное обновление Национальной базы данных позволяет проводить обширный мониторинг эпидемиологической ситуации в стране, отслеживать новые генетические варианты вируса, контролировать их распространение и делать прогнозы на будущее.

Данные, загруженные в международную базу GISAID, также играют важную роль в изучении генетических вариантов, циркулирующих в России, для ученых по всему миру, что позволяет получить более полное представление об эпидемиологической ситуации в стране.

Кроме того, специалистами ЦНИИ Эпидемиологии был разработан алгоритм PARuS для анализа геномных последовательностей SARS-CoV-2. Этот алгоритм позволяет корректировать и валидировать результаты анализа, полученные с использованием международных классификаторов, таких как Pangolin. PARuS обеспечивает более точную классификацию по фрагменту S-белка, содержащему информацию о ключевых мутациях, что особенно важно в условиях меняющейся реальности и пандемии.